Cara, não sei te informar como resolver o problema, mais sei que: quando some tudo é por que o processo
explorer. e x e (coloquei espaços por que o fórum não deixa colocar o formato) finaliza, esse processo comanda todas as janelas do computador, veja uma screenshot do meu computador:

Quando acontecer isso aperte
ctrl+
alt+
del e veja se o processo
explorer. e x e (novamente coloquei espaços por que o fórum não deixa colocar o formato) está em execução, se não estiver é por esse motivo que isto está acontecendo. Faça uma lista dos processos que estão em execução pra mim, vou ver se acho algum suspeito.
Tente fazer o download do
Ad-Aware e
Spybot e faça um scan, ou ainda tente baixar outro antivírus, o seu pode não estar conseguindo encontrar este vírus (recomendo o
Avira Antivírus), pra mim não há outra explicação pra isso a não ser vírus ou worm.
--Edição--
Depois que vi outro post você disse que as pastas fechavam, mais não, elas não fecham, elas apenas somem de vista, para vê-las segure
alt e aperte
tab, com isso vão aparecer todos os programas abertos.
Atenciosamente,
Fapstation